"Сколько можно? От этих героев больше вреда, чем пользы!", "Мой сын погиб по вине Железного Человека!!! Я требую справедливости!", "Это бесчеловечно! Разрушил все и улетел к чертовой бабушке! Мы требуем наказать Тора!", "Хэнк Пим - сумасшедший ученый! Изолируйте его от общества!"
     И так по всей стране. Бунты против супергероев назревали еще давно - например во время борьбы Железного Человека с Мандарином, или во время нападения читаури. Всегда найдутся недовольные. Но то была лишь искра, разгоревшаяся в настоящее пламя после того как создание Хэнка Пима - Альтрон выходит из под контроля и почти уничтожает такие крупные города, как Нью-Йорк и Сан-Франциско. Люди в ярости. Зловещее создание не пожалело их детей, нароно разрушив общеобразовательную школу с 500 учащимися. Люди обезумели от горя. Им все равно, что герои не могли предвидеть такого шага, они требуют возмездия, им мало, что проклятый робот пал от рук своего же создателя. Общественность требует от правительства США чрезвычайных мер в отношении супергероев. В связи со сложившейся ситуацией президент США принимает решение принять закон о регистрации супергероев. Сверхлюди будут обязаны раскрыть свою личность, пройти обучение подобно агентам ЩИТа и работать на правительство, по-прежнему помогая миру и людям, но уже официально. Ник Фьюри, собравший когда-то команду Мстителей, отстранен от работы и на его должность назначают Марию Хилл. Должность первого помощника достается Филу Коулсону. Мария Хилл сообщает Капитану Америке, что закон о регистрации все же появится, и приказывает ему арестовать всех несогласных с грядущим законом. Капитан отказывается выполнять приказ, более того он сам выступает против будущего законопроекта. Тогда Мария приказывает арестовать Стива, но тому с трудом все же удается бежать из штаба Щ.И.Т.а.
  Совбез ООН шокирован поступком Стива — лидер супергероев ушёл в подполье (по замыслу правительства, Стив должен был быть примером для всех незарегистрированных героев), Тони Старк вызывается найти нового лидера для суперлюдей.
Мстители раскалываются: Брюс, Тор (который оставил Асгард, чтобы жить вместе с Джейн), и Сокол уходят следом за Стивом, а Наташа Романофф, Клинт Бартон, Ртуть и Алая Ведьма остаются верны ЩИТу и его целям. Закон о регистрации принимают на следующий день. Творящаяся неразбериха только на руку злодеям, среди которых Локи и Амора, намеревающиеся захватить этот мир (впрочем, остальные почти все преследуют аналогичную цель). Герои собраются в два противоборствующих лагеря: Могучие Мстители и Тайные Мстители. Недавно оправившейся от нашествия Альтрона Америке грозит новое потрясение...